Генетическое типирование leuconostoc mesenteroides с помощью ПЦР
https://doi.org/10.47612/2220-8755-2019-14-40-49
Аннотация
Изучены возможности использования RAPD[1]ПЦР с праймерами: ERIC1R-1, ERIC2-1, BOXA1R, BOXA2R и Rep-ПЦР с праймерами P15, P16, XD8, XD9, RAPD-mes, (GTG)5 для выявления генетической гетерогенности 9 штаммов и 8 изолятов Leuconostoc mesenteroides. В результате филогенетического анализа, полученного при типировании лейконостоков, выделены три кластера культур с высоким уровнем будстрап-поддержки. Полученные результаты свидетельствуют о возможности выявлять генетические различия по профилю генерируемых ампликонов среди штаммов Leuconostoc mesenteroides с помощью комбинированного использования методов Rep[1]ПЦР и RAPD-ПЦР.
Об авторах
Е. Н. БирюкБеларусь
к.с-х.н.
Минск
Ю. С. Тарашкевич
Беларусь
Минск
Н. Н. Фурик
Беларусь
к.т.н.
Минск
Список литературы
1. Степаненко, П.П. Микробиология молока и молочных продуктов / П.П. Степаненко // Сергиев Посад: ООО «Все для Вас – Подмосковье». – 1999. – 415 с.
2. Bergey’s Manual® of Systematic Bacteriology / eds. M. Goodfellow [et al.]. – New York, NY: Springer New York, 2012.
3. Шергин, Н.А. Улучшение качества сыров группы голландского путем совершенствования отбора лейконостоков в закваски: дисс. ... канд. технич. наук: 05.18.04. – Углич, 1985. – 246 c.
4. Соловьева, И.В. Биологические свойства лактобацилл. Перспективы использования в лабораториях Роспотребнадзора экспресс методов амплификации нуклеиновых кислот (МАНК) при контроле качества пищевых продуктов, БАД к пище, лекарственных форм, содержащих лактобациллы / И.В. Соловьева [и др.] // МедиАль. – 2014. – Т. 12. – № 2. – С. 29– 44.
5. Точилина, А.Г. Биохимическая и молекулярно-генетическая идентификация бактерий рода Lactobacillus: дис…канд. биол. наук: 03.00.04, 03.00.07. – Нижний Новгород, 2009. – 148 с.
6. Chentouf, H.F. Isolation and identification of Leuconostoc mesenteroides producing bacteriocin isolated from Algerian raw camel milk / H.F. Chentouf, B. Zineb // Afr. J. Microbiol. Res. – 2013. – Vol. 7. - № 23. – pp. 2961–2969.
7. Dimic, G. Characteristics of the Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strains from fresh vegetables / G. Dimic // Acta Period. Technol. – 2006. – № 37. – pp. 3–11.
8. Schillinger, U.A genus-specific PCR method for differentiation between Leuconostoc and Weissella and its application in identification of heterofermentative lactic acid bacteria from coffee fermentation / U. Schillinger, B. Boehringer, S. Wallbaum, L. Caroline, A. Gonfa, M. Huch (née Kostinek), W. H. Holzapfel, C. M.A.P. Franz// FEMS Microbiol. Lett. – 2008. – Vol. 286. – № 2. – pp. 222–226.
9. Alegría, Á. Identification, typing, and functional characterization of Leuconostoc spp. strains from traditional, starter-free cheeses / Á. Alegría, S. Delgado, A. Belén Flórez, B. Mayo // Dairy Sci. Technol. – 2013. – Vol. 93. – № 6. – pp. 657–673.
10. Fatma, C. H. Isolation and identification of Leuconostoc mesenteroides producing bacteriocin isolated from Algerian raw camel milk / C. H.Fatma, Z. Benmechernene // Afr. J. Microbiol. Res. – 2013. – Vol. 23. – № 7. – pp. 2961–2969.
11. Слизень, В.В. Генетическое типирование Salmonella enterica с помощью ПЦР / В.В. Слизень, Ж.Ф. Циркунова, Е.И. Гудкова, О.Ч. Глаз. // Медицинский Журнал. – T. 3. – № 49. – C. 93–97.
12. Van de Peer, Y. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment / Y. Van de Peer, R. De Wachter // Bioinformatics. – 1994. – Vol. 10. – № 5. – pp. 569–570.
13. Mathis, D.L. Variation in Salmonella Enteritidis RAPD-PCR Patterns May Not Be Due to Genetic Differences / D.L. Mathis, R.D. Berghaus, M.D. Lee, J.J. Maurer // Avian Dis. – 2011. – Vol. 55. - № 4. – pp. 620-625.
14. Saxena, M.K. Strain differentiation of Indian isolates of Salmonella by ERIC-PCR / M.K.Saxena, V.P. Singh, B.D. Lakhcharua, G.Taj, B. Sharma // Res. Vet. Sci. – 2002. – Vol. 73. – № 3. – P. 313– 314
Рецензия
Для цитирования:
Бирюк Е.Н., Тарашкевич Ю.С., Фурик Н.Н. Генетическое типирование leuconostoc mesenteroides с помощью ПЦР. Актуальные вопросы переработки мясного и молочного сырья. 2019;1(14):40-49. https://doi.org/10.47612/2220-8755-2019-14-40-49
For citation:
Biruk A., Tarashkevich Y., Furik N. Genetic typing of leuconostoc mesenteroides using PCR. Topical Issues of Processing of Meat and Milk Raw Materials. 2019;1(14):40-49. (In Russ.) https://doi.org/10.47612/2220-8755-2019-14-40-49