МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ БАКТЕРИЙ РОДА LACTOCOCCUS
Аннотация
В работе проведена оценка методов внутривидовой генотипической дифференциации бактерий вида Lactococcus lactis. Установлено, что наиболее эффективны методы Rep- и RAPD-ПЦР. Метод риботипирования (ITS-RFLP) оказался непригодным для внутривидовой дифференциации бактерий данного вида. В результате генотипирования коллекционные штаммы бактерий (20 штаммов) были разделены на четыре генетически гетерогенные группы.
Об авторах
Е. Н. Бирюк
Институт мясо-молочной промышленности
Беларусь
Беларусь
Минск
Е. Н. Сысолятин
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Минск
К. К. Яцевич
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси
Россия
Россия
Минск
Д. В. Галиновский
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Минск
Н. Н. Фурик
Институт мясо-молочной промышленности
Беларусь
Беларусь
Минск
Список литературы
1. Ruiz, Р. Intraspecific genetic diversity of lactic acid bacteria from malolactic fermentation of Cencibel wines as derived from combined analysis of RAPD-PCR and PFGE patterns // Patricia Ruiz, Pedro Miguel Izquierdo, Susana Sesen, M. Llanos Palop / Food Microbiology. – 25 (2008). – Р. 942–948.
2. Yavuz, E. RFLP of 16S-ITS rDNA region to differentiate Lactobacilli at species level / Elif Yavuz, Hatice Gunes, Cisem Bulut, Sebnem Harsa and A. Fazil Yenidunya // World Journal of Microbiology & Biotechnology 20: 535–537, 2004.
3. Patzak, J. Comparison of RAPD, STS, ISSR and AFLP molecular methods used for assessment of genetic diversity in hop (Humulus lupulus L.) / J. Patzak // Euphytica 121: 9–18, 2001.
4. Giraffa, G. Monitoring of the bacterial composition of dairy starter cultures by RAPD-PCR / Giorgio Giraffa, Lia Rossetti // Ital.J.Food Sc. – 2000. - V.12, N 4. - P. 403-423.
5. Dansakull, S. Application of Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) Marker for Typing of Saccharomycopsis fibuligera Isolated from Loog-pang, Kao-mag and Satho / Saowalak Dansakull, Vichein Leelawatcharamas1, Charoen Charoenchai and Hathairat Urairong // Kasetsart J. (Nat. Sci.) 43 : 339-347 (2009).
6. Liu, S. Optimising RAPD-PCR for Screening the Link of RAPD Markers to an Acid-resistant Gene in Oenococcus oeni / S. Liu, L. He, X. Li, X. Li // S. Afr. J. Enol. Vitic., Vol. 32, No. 2, 2011. – Р. 296-299.
7. Hamza, A. Use of the RAPD-PCR fingerprinting and API system for clustering lactic acid bacteria isolated from traditional Sudanse sour milk (Roab)/ A. Hamza, Eisa I. El Gaali, Ahmed A. Mahdi // African J. Biotechnology, 2009. – V. 8 (15). – P. 3399-3404.
8. Samarzija, D Application of RAPD analysis for identification of Lactococcus lactis subsp. cremoris strains isolated from artisanal cultures/ D. Samarzija, S. Sikora, S. Redzepović, N. Antunac, J. Havranek – Microbiol Res. 2002. V.157. P.13-17
9. Moschetti, G. Random amplified polymorphic DNA and amplified ribosomal DNA spacer polymorphism: powerful methods to differentiate Streptococcus thermophilus strains/ G. Moschetti, G. Blaiotta, M. Aponte, P. Catzeddu, F. Villani, P. Deiana, S. Coppola – J Appl Microbiol, 1998. V.85, P. 25-36.
10. Stern, M.J. Repetitive extragenic palindromic sequences: a major component of the bacterial genome / M.J. Stern, G.F. Ames, N.H. Smith, E.C. Robinson, C.F. Higgins – Cell. 1984. V.37 – P.1015 – 1026.
11. Versalovic, J. Distribution of repetitive DNA sequences in eubacteria and application to fingerprinting of bacterial genomes/ J. Versalovic, T. Koeuth, J.R. Lupski– Nucleic Acids Res. 1991. V.19 – P. 6823-6831.
12. Koeuth, T. Differential subsequence conservation of interspersed repetitive Streptococcus pneumoniae BOX elements in diverse bacteria/ T. Koeuth, J. Versalovic, J.R. Lupski– Genome Res. 1995. V.5. – P.408-418.
13. Rajashekara, G. SERE, a widely dispersed bacterial repetitive DNA element / G. Rajashekara, T. Koeuth, S. Nevile, A. Back, K.V. Nagaraja, J.R. Lupski, V. Kapur – J. Med. Microbiol. 1998. V.47. P. 489-497.
14. Van Belkum, A. Hermans P.W.M. Novel BOX repeat PCR assay for high-resolution typing of Streptococcus pneumoniae strains / A. Van Belkum, M. Sluijter, R. de Groot, H. Verbrugh – J. Clin. Microbiol. 1996. V.34. P.1176-1179.
15. Olive, D.M. Principles and applications of methods for DNA-based typing of microbial organisms. / D.M. Olive, P. Bean – J. Clin. Microbiol. 1999. V.37. P.1661-1669.
16. Williams, J.G.K. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers / J.G. Williams, A.R. Kubelik, K.J. Livak, J.A. Rafalski, S.V. Tingey – Nucleic Acids Res. 1990. V.18. – P. 6531-6535.
Рецензия
Для цитирования:
Бирюк Е.Н., Сысолятин Е.Н., Яцевич К.К., Галиновский Д.В., Фурик Н.Н. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ БАКТЕРИЙ РОДА LACTOCOCCUS. Актуальные вопросы переработки мясного и молочного сырья. 2013;(8):157-169.
For citation:
Biruk A.N., Sysaliatsin E.N., Yatsevich K.K., Galinousky D.V., Furik N.N. MOLECULAR-GENETIC DIFFERENTIATION OF LACTOCOCCUS. Topical Issues of Processing of Meat and Milk Raw Materials. 2013;(8):157-169. (In Russ.)
Просмотров: 161
Послать статью по эл. почте 